Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGCLP35914 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGCLP35914 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGCLP35914 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCLP35914 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms