Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC13P31276 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC13P31276 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC13P31276 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC13P31276 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC13P31276 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms