Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEBPBP17676 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CEBPBP17676 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEBPBP17676 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEBPBP17676 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEBPBP17676 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1164.5 ms