Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB9P17482 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB9P17482 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms