Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GLI1P08151 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GLI1P08151 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI1P08151 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLI1P08151 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GLI1P08151 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI1P08151 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI1P08151 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI1P08151 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLI1P08151 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI1P08151 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI1P08151 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI1P08151 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GLI1P08151 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI1P08151 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI1P08151 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GLI1P08151 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GLI1P08151 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GLI1P08151 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI1P08151 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GLI1P08151 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GLI1P08151 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI1P08151 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI1P08151 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI1P08151 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI1P08151 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GLI1P08151 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GLI1P08151 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI1P08151 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI1P08151 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI1P08151 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI1P08151 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI1P08151 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI1P08151 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI1P08151 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI1P08151 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI1P08151 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI1P08151 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI1P08151 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI1P08151 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI1P08151 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI1P08151 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI1P08151 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI1P08151 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI1P08151 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI1P08151 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI1P08151 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI1P08151 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI1P08151 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI1P08151 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI1P08151 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI1P08151 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI1P08151 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI1P08151 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI1P08151 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI1P08151 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI1P08151 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI1P08151 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI1P08151 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI1P08151 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms