Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C8AP07357 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C8AP07357 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C8AP07357 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8AP07357 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8AP07357 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8AP07357 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C8AP07357 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C8AP07357 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C8AP07357 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C8AP07357 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C8AP07357 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C8AP07357 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C8AP07357 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C8AP07357 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C8AP07357 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C8AP07357 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C8AP07357 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C8AP07357 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C8AP07357 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C8AP07357 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C8AP07357 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C8AP07357 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C8AP07357 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8AP07357 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8AP07357 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8AP07357 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8AP07357 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C8AP07357 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8AP07357 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8AP07357 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8AP07357 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C8AP07357 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C8AP07357 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C8AP07357 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8AP07357 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8AP07357 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8AP07357 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8AP07357 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C8AP07357 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C8AP07357 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8AP07357 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C8AP07357 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C8AP07357 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8AP07357 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C8AP07357 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8AP07357 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C8AP07357 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C8AP07357 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C8AP07357 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C8AP07357 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8AP07357 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C8AP07357 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C8AP07357 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8AP07357 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8AP07357 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8AP07357 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8AP07357 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C8AP07357 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C8AP07357 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms