Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM2O75603 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCM2O75603 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCM2O75603 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM2O75603 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM2O75603 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM2O75603 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM2O75603 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM2O75603 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM2O75603 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM2O75603 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM2O75603 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM2O75603 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM2O75603 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM2O75603 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM2O75603 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM2O75603 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM2O75603 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM2O75603 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM2O75603 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCM2O75603 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCM2O75603 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCM2O75603 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM2O75603 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCM2O75603 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCM2O75603 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCM2O75603 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCM2O75603 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCM2O75603 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM2O75603 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM2O75603 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM2O75603 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM2O75603 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCM2O75603 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GCM2O75603 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM2O75603 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM2O75603 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM2O75603 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM2O75603 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM2O75603 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GCM2O75603 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM2O75603 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCM2O75603 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM2O75603 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM2O75603 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms