Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT3O75175 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT3O75175 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT3O75175 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms