Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NACAE9PAV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NACAE9PAV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NACAE9PAV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms