Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRR3A8MPY1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRR3A8MPY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRR3A8MPY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRR3A8MPY1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms