Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB6Q9Y5E3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB6Q9Y5E3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms