Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNMA8BQ9ULN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNMA8BQ9ULN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms