Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCTS1Q9ULC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCTS1Q9ULC4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCTS1Q9ULC4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTS1Q9ULC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms