Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNFX1Q9P2E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNFX1Q9P2E3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNFX1Q9P2E3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNFX1Q9P2E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNFX1Q9P2E3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms