Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CABP1Q9NZU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CABP1Q9NZU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CABP1Q9NZU7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CABP1Q9NZU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CABP1Q9NZU7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms