Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPF1Q9NWY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HPF1Q9NWY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPF1Q9NWY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms