Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS4Q9NQG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HPS4Q9NQG7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPS4Q9NQG7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS4Q9NQG7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.8 ms