Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPRTNQ9H040 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPRTNQ9H040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRTNQ9H040 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms