Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD5Q99717 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD5Q99717 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD5Q99717 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD5Q99717 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms