Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDF2Q99470 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF2Q99470 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF2Q99470 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms