Protein–RNA interactions for Protein: Q96FH0

BORCS8, BLOC-1-related complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS8Q96FH0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS8Q96FH0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS8Q96FH0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BORCS8Q96FH0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS8Q96FH0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms