Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF21BQ96EK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF21BQ96EK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF21BQ96EK2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF21BQ96EK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms