Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPDL3AQ92484 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPDL3AQ92484 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPDL3AQ92484 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms