Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRMLQ8N4K4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRMLQ8N4K4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRMLQ8N4K4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRMLQ8N4K4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms