Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A2Q8N370 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC43A2Q8N370 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC43A2Q8N370 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC43A2Q8N370 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC43A2Q8N370 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms