Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIX1LQ8IVB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIX1LQ8IVB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIX1LQ8IVB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIX1LQ8IVB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms