Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDB1Q86U70 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDB1Q86U70 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LDB1Q86U70 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDB1Q86U70 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms