Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT2Q7L5N7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LPCAT2Q7L5N7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT2Q7L5N7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT2Q7L5N7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms