Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VHLLQ6RSH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VHLLQ6RSH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VHLLQ6RSH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VHLLQ6RSH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms