Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNRNP48Q6IEG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRNP48Q6IEG0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRNP48Q6IEG0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRNP48Q6IEG0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms