Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EEF1DP3Q658K8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EEF1DP3Q658K8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EEF1DP3Q658K8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EEF1DP3Q658K8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EEF1DP3Q658K8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms