Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A13Q5J8X5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A13Q5J8X5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A13Q5J8X5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A13Q5J8X5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A13Q5J8X5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms