Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM30BQ3MIR4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM30BQ3MIR4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM30BQ3MIR4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms