Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNPS1Q15287 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNPS1Q15287 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNPS1Q15287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNPS1Q15287 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNPS1Q15287 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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