Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCBP1Q09161 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCBP1Q09161 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCBP1Q09161 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCBP1Q09161 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.9 ms