Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPARAQ07869 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PPARAQ07869 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPARAQ07869 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PPARAQ07869 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPARAQ07869 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms