Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDR2Q01850 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDR2Q01850 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDR2Q01850 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDR2Q01850 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms