Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SATB1Q01826 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SATB1Q01826 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SATB1Q01826 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms