Protein–RNA interactions for Protein: P80404

ABAT, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABATP80404 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABATP80404 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABATP80404 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABATP80404 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABATP80404 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABATP80404 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABATP80404 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABATP80404 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABATP80404 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABATP80404 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABATP80404 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABATP80404 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABATP80404 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABATP80404 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABATP80404 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABATP80404 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABATP80404 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABATP80404 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABATP80404 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABATP80404 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABATP80404 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABATP80404 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABATP80404 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABATP80404 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABATP80404 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABATP80404 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABATP80404 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABATP80404 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABATP80404 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABATP80404 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABATP80404 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABATP80404 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABATP80404 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABATP80404 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ABATP80404 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABATP80404 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABATP80404 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABATP80404 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABATP80404 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABATP80404 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABATP80404 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABATP80404 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABATP80404 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABATP80404 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABATP80404 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABATP80404 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABATP80404 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABATP80404 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABATP80404 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABATP80404 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABATP80404 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABATP80404 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABATP80404 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABATP80404 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABATP80404 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABATP80404 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABATP80404 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABATP80404 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABATP80404 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABATP80404 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABATP80404 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABATP80404 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABATP80404 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms