Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PITX1P78337 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PITX1P78337 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITX1P78337 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITX1P78337 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PITX1P78337 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PITX1P78337 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PITX1P78337 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PITX1P78337 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PITX1P78337 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITX1P78337 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITX1P78337 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITX1P78337 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITX1P78337 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PITX1P78337 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITX1P78337 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITX1P78337 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITX1P78337 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PITX1P78337 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITX1P78337 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITX1P78337 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITX1P78337 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PITX1P78337 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITX1P78337 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITX1P78337 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PITX1P78337 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PITX1P78337 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PITX1P78337 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITX1P78337 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITX1P78337 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PITX1P78337 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITX1P78337 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITX1P78337 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PITX1P78337 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PITX1P78337 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PITX1P78337 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PITX1P78337 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITX1P78337 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITX1P78337 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PITX1P78337 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PITX1P78337 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms