Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP54P61011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP54P61011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP54P61011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRP54P61011 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRP54P61011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRP54P61011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRP54P61011 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRP54P61011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRP54P61011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP54P61011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP54P61011 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP54P61011 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP54P61011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP54P61011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP54P61011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP54P61011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP54P61011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP54P61011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP54P61011 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP54P61011 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP54P61011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP54P61011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP54P61011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP54P61011 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP54P61011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRP54P61011 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRP54P61011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP54P61011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP54P61011 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP54P61011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRP54P61011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRP54P61011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRP54P61011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP54P61011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP54P61011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRP54P61011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP54P61011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRP54P61011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRP54P61011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP54P61011 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRP54P61011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP54P61011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRP54P61011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRP54P61011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms