Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EFNA5P52803 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFNA5P52803 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFNA5P52803 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EFNA5P52803 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFNA5P52803 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms