Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCD1P33897 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCD1P33897 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCD1P33897 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCD1P33897 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCD1P33897 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms