Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL3RAP26951 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IL3RAP26951 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL3RAP26951 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL3RAP26951 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms