Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACO1P21399 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACO1P21399 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACO1P21399 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACO1P21399 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACO1P21399 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACO1P21399 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACO1P21399 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACO1P21399 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACO1P21399 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACO1P21399 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACO1P21399 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACO1P21399 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACO1P21399 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACO1P21399 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACO1P21399 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACO1P21399 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACO1P21399 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACO1P21399 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACO1P21399 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACO1P21399 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACO1P21399 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACO1P21399 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACO1P21399 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACO1P21399 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACO1P21399 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACO1P21399 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACO1P21399 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACO1P21399 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACO1P21399 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ACO1P21399 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACO1P21399 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACO1P21399 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACO1P21399 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACO1P21399 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACO1P21399 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACO1P21399 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACO1P21399 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACO1P21399 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACO1P21399 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACO1P21399 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACO1P21399 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACO1P21399 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACO1P21399 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACO1P21399 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACO1P21399 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACO1P21399 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms