Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2CP19387 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2CP19387 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2CP19387 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2CP19387 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2CP19387 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms