Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA4P13612 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA4P13612 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA4P13612 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA4P13612 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA4P13612 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms