Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEFMP07197 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEFMP07197 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NEFMP07197 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFMP07197 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFMP07197 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFMP07197 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NEFMP07197 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFMP07197 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFMP07197 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFMP07197 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFMP07197 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NEFMP07197 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFMP07197 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFMP07197 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEFMP07197 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NEFMP07197 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEFMP07197 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEFMP07197 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFMP07197 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFMP07197 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEFMP07197 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFMP07197 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFMP07197 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFMP07197 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NEFMP07197 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFMP07197 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFMP07197 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFMP07197 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEFMP07197 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFMP07197 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFMP07197 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFMP07197 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEFMP07197 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFMP07197 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFMP07197 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFMP07197 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFMP07197 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEFMP07197 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEFMP07197 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEFMP07197 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NEFMP07197 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFMP07197 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFMP07197 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFMP07197 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFMP07197 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEFMP07197 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFMP07197 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFMP07197 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFMP07197 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEFMP07197 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEFMP07197 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
NEFMP07197 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFMP07197 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFMP07197 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFMP07197 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFMP07197 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEFMP07197 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFMP07197 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEFMP07197 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFMP07197 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFMP07197 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEFMP07197 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEFMP07197 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFMP07197 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFMP07197 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFMP07197 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFMP07197 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NEFMP07197 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NEFMP07197 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEFMP07197 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEFMP07197 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEFMP07197 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEFMP07197 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFMP07197 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFMP07197 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFMP07197 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEFMP07197 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEFMP07197 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEFMP07197 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEFMP07197 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFMP07197 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFMP07197 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFMP07197 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFMP07197 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFMP07197 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NEFMP07197 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NEFMP07197 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEFMP07197 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEFMP07197 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFMP07197 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFMP07197 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms