Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFNB1P01574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFNB1P01574 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNB1P01574 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFNB1P01574 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms