Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSA2O95478 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSA2O95478 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSA2O95478 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSA2O95478 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSA2O95478 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSA2O95478 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSA2O95478 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSA2O95478 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSA2O95478 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSA2O95478 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSA2O95478 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSA2O95478 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSA2O95478 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSA2O95478 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSA2O95478 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSA2O95478 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSA2O95478 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSA2O95478 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSA2O95478 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSA2O95478 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSA2O95478 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSA2O95478 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSA2O95478 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSA2O95478 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSA2O95478 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSA2O95478 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSA2O95478 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NSA2O95478 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSA2O95478 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSA2O95478 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSA2O95478 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSA2O95478 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSA2O95478 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSA2O95478 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSA2O95478 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSA2O95478 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSA2O95478 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSA2O95478 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSA2O95478 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSA2O95478 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSA2O95478 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSA2O95478 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSA2O95478 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSA2O95478 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSA2O95478 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSA2O95478 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSA2O95478 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSA2O95478 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSA2O95478 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSA2O95478 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSA2O95478 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSA2O95478 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSA2O95478 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSA2O95478 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSA2O95478 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms